55
RhoC, RhoB, RhoG und RhoD (Abb. D5):
Auch die Deamidierung von RhoC, RhoB und RhoG wurde nachgewiesen. Sowohl an den
Absorbtionskurven der Proben, die die Rho-GTPase und CNF1 enthalten, als auch an deren
Regressionsgeraden ist im Vergleich zu den Kontrollkurven ein schnellerer Abfall, und damit
eine schnellere Ammoniakentstehung zu erkennen. RhoD hingegen wurde nicht durch CNF1
deamidiert. Weder die Absorptionskurve der Probe mit RhoD und CNF1 fällt stärker ab, noch
hat die Regressionsgerade dieser Kurve eine andere Steigung als die Kurven der
Einzelproteine.
Abb. D5: Deamidierung durch CNF1
: Absorptionskurven und Regression der Absorptionskurven im
Anfangsbereich (Zeit: 0-200 s); die Bestimmung der Ammoniakfreisetzung wurde für jede Rho-GTPase einmal
durchgeführt; mit RhoD wurde der Versuch zweimal durchgeführt; Beachte: der Absorbtionsabfall der
Kontrollkurven (nur GTPase) ist mit unspezifischer Ammoniakbildung zu erklären.
CNF1
RhoB +
CNF1
RhoB
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
0
100
200
300
400
500
600
CNF1
RhoB +
CNF1
RhoB
CNF1
RhoB +
CNF1
RhoB
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
CNF1
RhoB
RhoB +
CNF1
Regression
m = -0,09
m = -0,14
m = -0,35
400
420
440
460
480
500
520
540
0 50 100 150 200 250
Zeit (s)
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
0
100
200
300
400
500
600
CNF1
RhoC +
CNF1
RhoC
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
CNF1
RhoC +
CNF1
RhoC
CNF1
RhoC +
CNF1
RhoC
CNF1
RhoC
RhoC +
CNF1
Regression
m = -0,14
m = -0,14
m = -0,35
400
420
440
460
480
500
520
540
0 50 100 150 200 250
Zeit (s)
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
0
100
200
300
400
500
600
CNF1
RhoG +
CNF1
RhoG
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
CNF1
RhoG +
CNF1
RhoG
CNF1
RhoG +
CNF1
RhoG
m = -0,07
m = -0,12
m = -0,40
400
420
440
460
480
500
520
540
0 50 100 150 200 250
Zeit (s)
CNF1
RhoG
RhoG +
CNF1
Regression
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
0
100
200
300
400
500
600
CNF1
RhoD +
CNF1
RhoD
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
CNF1
RhoD +
CNF1
RhoD
CNF1
RhoD +
CNF1
RhoD
m = -0,14
m = -0,03
m = -0,07
400
420
440
460
480
500
520
540
0 50 100 150 200 250
Zeit (s)
CNF1
RhoD
RhoD +
CNF1
Regression
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
CNF1
RhoB +
CNF1
RhoB
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
0
100
200
300
400
500
600
CNF1
RhoB +
CNF1
RhoB
CNF1
RhoB +
CNF1
RhoB
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
CNF1
RhoB
RhoB +
CNF1
Regression
m = -0,09
m = -0,14
m = -0,35
400
420
440
460
480
500
520
540
0 50 100 150 200 250
Zeit (s)
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
0
100
200
300
400
500
600
CNF1
RhoC +
CNF1
RhoC
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
CNF1
RhoC +
CNF1
RhoC
CNF1
RhoC +
CNF1
RhoC
CNF1
RhoC
RhoC +
CNF1
Regression
m = -0,14
m = -0,14
m = -0,35
400
420
440
460
480
500
520
540
0 50 100 150 200 250
Zeit (s)
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
0
100
200
300
400
500
600
CNF1
RhoG +
CNF1
RhoG
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
CNF1
RhoG +
CNF1
RhoG
CNF1
RhoG +
CNF1
RhoG
m = -0,07
m = -0,12
m = -0,40
400
420
440
460
480
500
520
540
0 50 100 150 200 250
Zeit (s)
CNF1
RhoG
RhoG +
CNF1
Regression
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
0
100
200
300
400
500
600
CNF1
RhoD +
CNF1
RhoD
Zeit (s)
0 2000 4000 6000
CNF1
RhoD +
CNF1
RhoD
CNF1
RhoD +
CNF1
RhoD
m = -0,14
m = -0,03
m = -0,07
400
420
440
460
480
500
520
540
0 50 100 150 200 250
Zeit (s)
CNF1
RhoD
RhoD +
CNF1
Regression
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
Absorption
(arbiträre Einheiten
)
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